Аманда Рипли отправляется искать ответы об исчезновении своей матери и оказывается на станции «Севастополь», где порядок разрушен, а выживших преследует ксеноморф. Прямой бой с главным противником почти всегда заканчивается гибелью, поэтому главное оружие — осторожность.
Игрок исследует тёмные отсеки, собирает ресурсы, создаёт инструменты и отвлекающие устройства, прячется и следит за движением угрозы. Игра строится на постоянном напряжении, непредсказуемом поведении Чужого и атмосфере первого фильма серии.